日本國立感染症研究所將變種新冠病毒Omicron，列為「需要警惕的變異病毒株」，達到最高警戒級別。研究所將分析病毒基因，短期內會研發出專用的病毒檢測方法，務求迅速找出疑似病例。
日本厚生勞動省已通知地方政府，要求盡可能迅速對病毒樣本進行基因分析，特別是針對入境後14日內確診的患者，以了解國內的Omicron感染情況。
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